阴离子聚丙烯酰胺分子量为1800万，水解度为20-30。非离子聚丙烯酰胺分子量为1200万，水解度为0-10。根据指标不同，阴离子聚丙烯酰胺与非离子聚丙烯酰胺区别主要是分子量与聚丙烯酰胺水解度的差异。
聚丙烯酰胺水的解度，阴离子聚丙烯酰胺是通过加碱水解制得的，碱量大小控制了聚丙烯酰胺水解度大小，什么是聚丙烯酰胺水解度呢？我们理解为聚丙烯酰胺水解出羧基量的大小，水解出的羧基阴离子在静电斥力作用下可使分子链展开，以此来暴漏出酰胺基团分子链，从而发挥吸附架桥作用。
由于聚丙烯酰胺作用中有电中和原理，所以不同型号聚丙烯酰胺水解度可使水中的负电荷不同，可以直接影响其处理效果，如洗煤用聚丙烯酰胺，选矿用聚丙烯酰胺这些对水解度要求很高的水质，所以选择出*水解度的产品是保证杂质沉降快慢及水质澄清度的重中之重。
聚丙烯酰胺分子量，聚丙烯酰胺分子量可以代表聚丙烯酰胺分子链的长短，当分子链长时，其可吸附架桥的物质就越多，但是当水质浊度小时，可选择的聚丙烯酰胺分子量就会低。阴离子聚丙烯酰胺由于加碱多，水解完全，固其分子量较高，而非离子聚丙烯酰胺加碱较少，后期限制其聚合，固其分子量相对较低。当水质对水解度要求不高时，分子量就成为聚丙烯酰胺加量的主导因素，分子量越高，其加量越少，反之，分子量越低，加量越大。
水解度完全决定了阴离子聚丙烯酰胺与非离子聚丙烯酰胺是否能很好的处理污水，而分子量则是决定聚丙烯酰胺用量大小的关键因素。
